SOOOG heeft een Gemeenschappelijke Medezeggenschapsraad (GMR). De GMR houdt zich bezig met dingen die belangrijk zijn voor de scholen van SOOOG.
Elke school heeft een eigen medezeggenschapsraad (MR). Leden van de GMR worden gekozen door de leden van deze medezeggenschapsraden. GMR-leden hoeven geen lid te zijn van een medezeggenschapsraad. Wel moeten ze als ouder/verzorger of personeelslid betrokken zijn bij een school van SOOOG.
De GMR heeft een aantal specifieke rechten. Die staan in artikel 16 van de Wet medezeggenschap op scholen. Ieder jaar schrijft de GMR een jaarverslag en een jaarplan.